探明文物家底，制定保护措施。经过300多位科学工作者在湖北省的宜昌、秭归、兴山、巴东，重庆市的巫山、巫溪、奉节、云阳、万县、开县、忠县、石柱、丰都、武隆、涪陵、长寿、江北、巴县、江津和重庆市区共20个市县，历经一年多艰难跋涉考察，于1995年3月形成了一个初步的三峡工程淹没区文物清单。
据初步统计，在三峡工程淹没区内，已发现文物点1208 处，其中地面文物441处，包括各种结构的古建筑215处，石刻造像123处，桥梁及其他103处；地下文物767处，包括古遗址460处，古墓葬(墓群)307处，地下文物的埋葬总量达2200余万平方米。这些文物点包括1处国家重点文物保护单位，10余处省级重点文物保护单位。另外，还有4、5处文物遗存正在申报第四批国家重点文物保护单位。
针对以上不同的文物 、所处的不同位置，专家们提出了不同的保护措施。对于地下文物，继续进行考古勘探，以便进一步掌握地下文物的各种详细情况，为以后的考古发掘奠定基础。
地面文物的保护主要分为三类：一类是就地保护。如白鹤梁枯水题刻，忠县石宝寨、白帝城等。第二类是搬迁保护。如张飞庙、屈原寺、秋风亭、大昌民居等将进行整体搬迁。对大量的石刻、题记、石窟、造像等可将其切割下来，凿石搬迁。第三类是取齐资料。对一些不可能搬迁的文物，取齐资料，为以后的研究提供原始依据。
抢救保护有价值的文物也是建设部门义不容辞的责任，有关经费将在工程概算中列支。中国长江三峡开发总公司作为修建三峡工程的业主，有责任也有义务为保护好文物尽力。一是全力保证三峡文物保护工作的费用支付，并做到及时到位；二是签订施工合同时增加文物保护条款，教育全体三峡建设人员树立文物保护意识；三是在工程安排、移民开发、新城建筑等各项工作中兼顾文物环境保护工作的进行。国家已批准投入3.5亿元的静态投资，用以对三峡库区文物的发掘及保护。
按计划，1995年至2000年，完成约70%的工作量，重点完成155米高程下的文物保护工作；2001年至2005年，按计划完成三峡淹没区文物保护工作 。
那么，三峡大坝建成后，三峡地区的自然景观又是什么样子呢？三峡水库水位抬高到145至175米高程，必然要淹没一些景点，但总体说来，对三峡地区山高峰秀、壁陡峡窄、水曲回环的风光的影响是有限的。一是每年四、五月至十月，由于要防洪，坝前水位将降至145米，几乎不影响诸峡的风光。而这一段时间正是旅游高峰期。二是三峡的两岸山峰峰顶高程多在1000至1500米，即使水位升高30米至80米，狭谷感不会被减弱，高峡依在，新增平湖，景色更为壮美。
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